中日经贸关系并没有随着在华日企工厂的复工而恢复，在中日关系继续僵持的情况下，外界不免担忧未来中日经贸关系将持续恶化，或者说存在不确定的变数。
至少日本企业家已经忧心忡忡。《日本经济新闻》截至9月21日对100名日本企业家的调查显示，近七成企业家担心，日本与中韩两国的领土争端会给企业带来负面影响。《日本经济新闻》称，参与该调查的不少企业是在中国反日游行最激烈的9月18日前做出的答复。
与该调查类似的是路透社在大规模游行爆发前对400家日本大中型企业进行的调查，约260家受访企业在8月31日至9月14日期间给出反馈。其中41%的企业认为中日摩擦影响其商业计划，一些日本企业考虑暂时推迟进入中国市场的计划，甚至是撤离中国并将业务迁往其他地区。
值得注意的是，在路透社的调查中，只有2%的受访企业认为与亚洲国家保持平稳外交关系是最重要的，超过一半的企业认为下届日本政府应优先考虑振兴经济和稳定汇率。
日本明治大学国际合作政策研究所所长、日本智库东京财团研究员关山健此前在接受早报记者采访时也提醒称，部分日本企业或在考虑离开中国的战略。
日本贸易会会长枪田松莹也曾提醒，对华投资今后将不得不慎重考虑。日本是中国第二大外资来源地。
在日本企业担忧的同时，中日间经济界高层的往来也陷入停滞状态，日本媒体开始出现关于中日“政冷经冷”的声音。此前即便中日关系紧张，也没有对两国经济造成严重影响，“政冷经热”格局一直为外界称道。
据共同社报道，日中经济协会已经推迟了原定于25日前往北京的访华团行程，如果年内中日双方协调未果，将成为38年来该活动首度停办。不过，27日下午，7个日中友好团体会长将在北京与中国政府高官进行小规模的会谈。
数据显示，中国是日本最大的贸易伙伴，而日本是中国第三大贸易伙伴，去年双边贸易额超过3400亿美元；中国占日本整体贸易额20%，占比几乎是美国的两倍。
日本经济已经“伤不起”。如果中日关系持续恶化，中国对日本商品抵制扩大，可能对日本汽车和电子商品的最终产品出口造成负面影响。假设日本汽车相关产品对华出口暂停一个月，《日本经济新闻》推算，日本国内企业生产活动遭受的损失约为3000亿日元。此外，如果摩擦持续发酵，出口被拉低，日本经济复苏的时间可能延后。
以此前中日摩擦不算严重时为例，日本第一生命经济研究所推算，2010年撞船事件时，中国赴日本的游客减少了18万人，日本国内消费减少了318亿日元。对贸易方面的影响，可以参照的是2005年时的情况，据推算，当时日本对华出口下滑了4697亿日元，相当于日本出口总额的5.1%。
顺利解决双方争端并非易事，即便双方能够心平气和地坐下来谈判。
此前有消息称，日本前首相鸠山由纪夫也将应邀访华，但昨日共同社报道称鸠山由纪夫已经回绝了邀请，“不希望访问造成某种影响。”
鸠山由纪夫昨晚出席了中国驻日大使馆在东京举行的国庆63周年招待会。据中新社报道，除了鸠山由纪夫，前日本首相村山富市、福田康夫，以及经团联会长米仓弘昌等约1000名日中政治和经济界人士参加了招待会。
同一天，中国外交部副部长张志军与日本常务副外长河相周夫在北京就当前中日关系特别是钓鱼岛问题举行磋商。《日本经济新闻》称，双方加上午饭时间，会谈进行了4个多小时，但最终是平行线，在领土主权问题上，相互做出让步的空间很小。